Main tasks

L'équipe RTOP, dirigée par le Dr Gudrun Schleiermacher à l'Institut Curie (Paris), recherche un ingénieur de recherche (bio-informaticien), expert en analyses NGS en oncologie pédiatrique et tumeurs rares.

Le candidat devra justifier d'une expérience en recherche oncologique ou en génomique translationnelle du cancer et d'une forte motivation

L'ingénieur de recherche contribuera à l'analyse, à l'intégration et à l'interprétation de jeux de données NGS complexes, principalement issus d'échantillons de patients.

Le candidat retenu intégrera une équipe dynamique, internationale et multidisciplinaire et travaillera en collaboration avec des biologistes, des cliniciens et des bio-informaticiens, contribuant ainsi au développement, à l'optimisation et à la mise en œuvre de flux de travail analytiques et bio-informatiques robustes.

Projet de recherche : Ce projet vise à approfondir la compréhension des mécanismes d'oncogenèse et de la progression tumorale dans les cancers pédiatriques à haut risque et les cancers rares, grâce à l'analyse moléculaire d'échantillons provenant de patients.

Les travaux portent sur l'identification des altérations génétiques associées à la progression tumorale et à la résistance aux traitements, principalement par l'analyse de biopsies liquides (ADN tumoral circulant), et intègrent des approches moléculaires complémentaires, notamment le profilage épigénétique.

L'ingénieur(e) de recherche travaillera en étroite collaboration avec les membres de l'équipe et contribuera à la production, à l'analyse et à l'interprétation des données à l'aide de chaînes de traitement analytiques et bio-informatiques standardisées et validées.

Missions et responsabilités :

·       Contribution à l'intégration et à l'analyse de données multi-omiques issues d'échantillons de patients.

·       Participation au développement, à l'optimisation et à l'application de nouvelles approches analytiques pour la biopsie liquide.

·       Soutien à la mise en œuvre, à la maintenance et à la documentation des flux de travail analytiques et bio-informatiques.

·       Veille technologique et bibliographique en oncologie pédiatrique, technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS) et méthodologies de biopsie liquide.

·       Contribution à l'interprétation des données, à la rédaction des rapports et à la diffusion scientifique, y compris la participation à la préparation des manuscrits et aux communications scientifiques, le cas échéant.